環状オリゴ合成サービス

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環状オリゴヌクレオチド合成

Circular Oligonucleotide Synthesis

一本鎖の環状DNAや環状RNAオリゴヌクレオチドは、一本鎖のDNAやRNAのターゲットと三重構造を形成するように設計されています。これらの環状オリゴヌクレオチドの多くは、直鎖オリゴヌクレオチドと比較して、高い親和性、配列選択性、ヌクレアーゼに対する耐性を有しています。これらの合成環状DNA・RNAオリゴヌクレオチドを、バイオシンセシス社により、部分的に保護された線状前駆体から溶液および固相合成法を用いて化学的に合成するサービスを提供いたします。直鎖状DNAを除去した後、変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)により、円形オリゴヌクレオチドは>95%の純度で精製されます。環状についてはエキソヌクレアーゼによる切断で判断します。最終的には、独立したQA手順を適用して、それぞれの円形オリゴヌクレオチドの品質を保証しています。

環状オリゴ概要

  • Length- 35 to 200 mers
  • Quantities- 100, 200, 500 pmole
  • Purification HPLC or PAGE purified
  • Validation- MS and PAGE analysis plus additional QA procedures

For additional information regarding custom circular DNA or RNA synthesis, send an email to biologicabiologica.co.jp or use contact form below.


Circular Oligonucleotide – A New Concept for Molecular Diagnostic

サーキュラーオリゴヌクレオチドは、DNAやRNAの鋳型として機能し、ローリングサークルPCR法で円形配列の長い繰り返しコピーを作ることができます。円形オリゴヌクレオチドを用いたその他の戦略は、診断や治療への応用において興味深い特性を示しております。

Anti sense using circular oligonucleotides
Binding of duplex DNA
Delivery vectors for miRNAs
DNA fragment assembly using a nicking enzyme system
Diagnostics
DNA polymerase inhibition
DNA structure studies
Efficient templates for DNA and RNA polymerases
Hairpin motif design
Hairpin studies
Ligation-independent cloning (LIC)
Manipulating gene expression with caged circular oligonucleotides
Mutation detection
Padlock probes
Probing DNA-protein interactions
Quantitation of sequence-dependent DNA bending and flexibility
RNA polymerase inhibition
Rolling Circle Amplification (RCA)
Single molecule counting
Specific gene expression
Study of noncanonical DNA structural motifs
Synthesis of concatemeric polypeptides
Topologic modifications
Triple helix formation
Unique DNA recognition properties

References
1. Diegelman, A. M. and Kool, E. T. (2000) Chemical and enzymatic methods for preparing circular single-stranded DNAs. In Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, vol. 2 (Beaucage, S. et al., eds.). John Wiley, New York, Chapter 5.2.
2. Oligonucleotide synthesis: methods and applications / edited by Piet Herdewijn. (Methods in molecular biology ; 288). ISBN 1-58829-233-


カスタム環状DNA、RNA合成サービスの具体例

バイオシンセシス社のカスタムDNAおよびカスタムRNA合成サービスは、様々な研究ニーズを満たすために多くのオプションを提供しています。お客様にご満足いただけるよう、ISO品質管理システムを導入しています。

Case Study

Sequence:91 base DNA Synthesis

TTC ACA GAG GAA GGG CCA GTA TCC TGT CCA AAC TTG ATG CTC CGG T CGT TTA GCA TAC TAA TCT GAG AGT CCG ACG GTC GTC AGT CAG TCA
Denaturing gel results:

ESI Mass Spectra:
Linear 91 mer ssDNA, target MW: 28128.1, observed MW: 28126.9

Circular 91 mer ssDNA, target MW: 28110.1, observed MW: 28111.1


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