オリゴDNA修飾の種類

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Shanghai Generay Bio-Synthesis

核酸の修飾ラインナップ

Generay社で合成する場合

修飾品の精製料金は無料です。PAGE or HPLCのいずれかをお選び下さい。

DeoxyInosine | DeoxyUridine | Phosphorylation | Attachment Chemistry & Linkers | Fluorophores | Dark Quenchers | Dual-Labeled DNA Probes | Molecular Beacons

修飾の種類 供給量 (10-60base) 修飾料金
DeoxyInosine (dI)
G010-DIP 2 ODs 2,500
G020-DIP 5 ODs 2,800
G040-DIP 10 ODs 3,600
G100-DIP 20 ODs 5,000
DeoxyUridine (dU)
G010-DUP 2 ODs 2,500
G020-DUP 5 ODs 2,800
G040-DUP 10 ODs 3,600
G100-DUP 20 ODs 5,000
Phosphorylation
5′ Phosphorylation
G010-PH5 2 ODs 4,600
G020-PH5 5 ODs 5,000
G040-PH5 10 ODs 6,100
G100-PH5 20 ODs 9,400
3′ Phosphorylation
G010-PH3 2 ODs 4,600
G020-PH3 5 ODs 5,000
G040-PH3 10 ODs 6,100
G100-PH3 20 ODs 9,400
Attachment Chemistry & Linkers
5’NH2 C6
G010-NH5 2 ODs 4,500
G020-NH5 5 ODs 5,200
G040-NH5 10 ODs 7,800
G100-NH5 20 ODs 11,100
3’NH2 C6
G010-NH3 2 ODs 4,500
G020-NH3 5 ODs 5,200
G040-NH3 10 ODs 7,800
G100-NH3 20 ODs 11,100
5’Biotin
G010-BT5 2 ODs 5,800
G020-BT5 5 ODs 7,300
G040-BT5 10 ODs 10,400
G100-BT5 20 ODs 15,000
3’Biotin
G010-BT3 2 ODs 6,200
G020-BT3 5 ODs 7,800
G040-BT3 10 ODs 11,200
G100-BT3 20 ODs 16,200
5’Digoxigenin
G010-DIG5 2 ODs 11,200
G020-DIG5 5 ODs 14,500
3’Digoxigenin
G010-DIG3 2 ODs 12,900
G020-DIG3 5 ODs 16,200
5′ Thiol Modifier C6 S-S
G010-SH5SS 2 ODs 11,200
G020-SH5SS 5 ODs 14,200
G040-SH5SS 10 ODs 19,500
G100-SH5SS 20 ODs 34,700
5′ Thiol Modifier C6 SH
G010-SH5SH 2 ODs 9,500
G020-SH5SH 5 ODs 12,000
G040-SH5SH 10 ODs 17,900
G100-SH5SH 20 ODs 26,300
3′ Thiol Modifier C3 S-S
G010-SH3SS 2 ODs 8,700
G020-SH3SS 5 ODs 11,200
G040-SH3SS 10 ODs 16,200
G100-SH3SS 20 ODs 23,800
5-Methyl dC
G010-METH 2 ODs 7,800
G020-METH 5 ODs 10,200
Fluorophores
5’6-FAM
G010-5FAM 2 ODs 6,200
G020-5FAM 5 ODs 7,800
G040-5FAM 10 ODs 11,200
G100-5FAM 20 ODs 16,200
3′ 6-FAM
G010-3FAM 2 ODs 6,200
G020-3FAM 5 ODs 7,800
G040-3FAM 10 ODs 11,200
G100-3FAM 20 ODs 16,200
5′ TET
G010-TET 2 ODs 8,700
G020-TET 5 ODs 9,600
G040-TET 10 ODs 13,000
G100-TET 20 ODs 21,700
5′ HEX
G010-HEX 2 ODs 8,700
G020-HEX 5 ODs 9,600
G040-HEX 10 ODs 13,000
G100-HEX 20 ODs 23,200
5′ TAMRA
G010-TAMRA5 2 ODs 8,700
G020-TAMRA5 5 ODs 11,200
G040-TAMRA5 10 ODs 16,200
G100-TAMRA5 20 ODs 23,800
3′ TAMRA
G010-TAMRA3 2 ODs 10,400
G020-TAMRA3 5 ODs 12,700
G040-TAMRA3 10 ODs 18,700
G100-TAMRA3 20 ODs 27,100
5′ ROX
G010-ROX5 2 ODs 10,400
G020-ROX5 5 ODs 12,900
G040-ROX5 10 ODs 18,700
G100-ROX5 20 ODs 27,100
3′ ROX
G010-ROX3 2 ODs 12,000
G020-ROX3 5 ODs 15,400
G040-ROX3 10 ODs 22,900
G100-ROX3 20 ODs 33,800
5′ JOE
G010-JOE5 2 ODs 10,400
G020-JOE5 5 ODs 12,900
G040-JOE5 10 ODs 18,700
G100-JOE5 20 ODs 27,100
3′ JOE
G010-JOE3 2 ODs 12,000
G020-JOE3 5 ODs 15,400
G040-JOE3 10 ODs 22,900
G100-JOE3 20 ODs 33,800
5’CY3
G010-5CY3 2 ODs 13,000
G020-5CY3 5 ODs 14,100
3’CY3
G010-3CY3 2 ODs 14,500
G020-3CY3 5 ODs 18,100
5’CY5
G010-5CY5 2 ODs 13,000
G020-5CY5 5 ODs 14,100
3’CY5
G010-3CY5 2 ODs 14,600
G020-3CY5 5 ODs 18,500
Dark Quenchers
3′ Dabcyl
G010-DAB3 2 ODs 9,500
G020-DAB3 5 ODs 12,700
G040-DAB3 10 ODs 18,700
G100-DAB3 20 ODs 24,500
3′ BHQ-1
G010-BHQ1 2 ODs 10,400
G020-BHQ1 5 ODs 12,900
G040-BHQ1 10 ODs 18,700
G100-BHQ1 20 ODs 24,500
3′ BHQ-2
G010-BHQ2 2 ODs 10,400
G020-BHQ2 5 ODs 12,900
G040-BHQ2 10 ODs 18,700
G100-BHQ2 20 ODs 25,000
Dual-Labeled DNA Probes
Molecular Beacons
5’6-FAM – 3’Dabcyl
G010-FD 2 ODs 19,500
G020-FD 5 ODs 25,000
5’HEX – 3’Dabcyl
G010-HD 2 ODs 19,500
G020-HD 5 ODs 25,000
5’TET – 3’Dabcyl
G010-TD 2 ODs 19,500
G020-TD 5 ODs 25,000
5’JOE – 3’Dabcyl
G010-JD 2 ODs 19,500
G020-JD 5 ODs 25,000
5’TAMRA – 3’Dabcyl
G010-TAD 2 ODs 24,300
G020-TAD 5 ODs 27,100
5’CY5 – 3’Dabcyl
G010-CD 2 ODs 21,700
G020-CD 5 ODs 23,900

Bio-Synthesis社で合成する場合

末端と内部の修飾 | 非放射性標識 | 改変 | ユーティリティ | 安定性増強 | 光切断 | コンジュゲーション | アンチセンス | 消光 | 蛍光 | 酸化還元 | 蛍光性プローブ | 多重化qPCR

長年にわたる多くの実績を持つBio-Synthesis Inc ( Texas )によるサービスです。
オリゴ合成中、または合成後の広範な修飾をおこなうことができます。Digoxigeninといくつかの蛍光色素については合成中の修飾ができませんが、この場合、合成後にNHSエステル法を使いオリゴに付加させます。
NHSエステルは1級アミンと反応し安定な共有結合のアタッチメントとなります。1級アミンはそれゆえに、希望するNHSエステルとの反応のため、オリゴ合成中にオリゴに加えられます。
オリゴ合成中の直接修飾に比べ、オリゴ合成後の修飾はその効率が低くなります。
全てのNHSエステルの修飾ではHPLC精製が必要となります。PAGEによる精製は収率が悪く、ときに修飾自体を壊してしまうこともあります。
各料金についてはお気軽にお問い合わせください。

Terminus and Internal Modifications

アクリジン | アルデヒド | アミノ | 分岐 | カルボキシ | ターミネーター | コレステリル | デンドリマー | グリセリル | リン酸化 | ソラレン | スペーサー | チオール

◆Acridine

  • Acridine
  • MeO-Cl-Acridine

◆Aldehyde

  • Aldehyde C2

◆Amino modifiers

  • Amino-Modifier C3
  • Amino-Modifier C6
  • 5′-Amino-Modifier C12
  • Amino-Modifier C7
  • Amino C6 dT / C2 dT
  • Amino C6 dC
  • Amino C6 dA
  • Amino C6 dG
  • Amio C6 dU
  • PC Amino Modifier

◆Branching

  • Symmetric Branching
  • Asymmetric Branching
  • 5-Me-dC Branching

◆Carboxy modifiers

  • Carboxy dT
  • Carboxy C10

Chain terminator

◆Cholesteryl

  • Cholesteryl TEG

◆Dendrimer

  • Symmetric Doubler
  • Assymmetric Doubler
  • Trebler
  • Long Trebler

◆Glyceryl

◆Phosphorylation

◆Psoralen

  • Psorlaen C2, C6

◆Spacer

  • C3 Spacer
  • C6 Spacer
  • C12 Spacer
  • Spacer 9
  • Spacer 18 (hexaethyleneglycol)
  • dSpacer (Abasic furan)
  • ribospacer rSpacer
  • Photocleavable PC Spacer

◆Thiol

  • Thiol C3 S-S
  • Dithiol (DTPA)
  • Thiol C6
  • Thiol C6 S-S

Non-radioactive Labelings

ビオチン | ジゴキシゲニン | DNP

◆Biotin

  • 5′ Biotin
  • Biotin
  • Desthiobiotin TEG
  • Biotin dT
  • Biotin TEG
  • 5′ Dual Biotin
  • PC Biotin

◆Digoxigenin

  • Digoxigenin
  • Digoxigenin dT

◆2,4-dinitrophenyl (DNP)

  • TEG-Dinitrophenol
  • Dinitrophenol

Bases with Altered Pairing

DNA損傷・修復 | デオキシウリジン | ハロゲン化 | イソシトシン・イソグアノシン | スパイク | ユニバーサル | 縮重

◆DNA damage/repair studies

  • 8-Oxo-dA
  • 8-Oxo-dG
  • 5-OH-dC
  • 5-OH-dU
  • 5-Hydroxymethyl-dU
  • 1-Me-dA
  • N3-Cyanoethyl-dT
  • 5,6-Dihydro-dU
  • Pyrene-dU
  • Perylene-dU

◆DeoxyUridine (dUracil)

◆Halogenated Bases

  • br-dU
  • 5-Br-dC
  • 8-Br-dA
  • 8-Br-dG
  • 5-I-dC
  • 5-I-dU
  • 5-F-dU

◆isoCytosine (iso-dC) and isoGuanosine (iso-dG)

  • IsoCytosine (iso-dC)
  • IsoGuanosine (iso-dG)

◆Spiked Oligos

◆Universal Bases

  • Deoxy Inosine (dI)
  • Nitroindole
  • 2′-DeoxyNebularine
  • 3-Nitropyrrole
  • dP
  • dK
  • dP + dK

◆Degenerate Base – Wobble

  • Inosine dI
  • dA+dG (R)
  • dC+dT (Y)
  • dA + dC (M)
  • dG + dT (K)
  • dC + dG (S)
  • dA + dT (W)
  • dA + dC + dT (H)
  • dC + dG + dT (B)
  • dA + dC + dG (V)
  • dA +dG + dT (D)
  • dA+dC+dG+dT (N)

PCR/Sequencing Utilities

二本鎖効果 | ターミネーター

◆Duplex Effects

  • Deoxy Inosine (dI)
  • deoxyUridine (dUracil)
  • Nitroindole
  • 2′-DeoxyNebularine
  • 3-Nitropyrrole
  • dP
  • dK
  • dP + dK
  • dmf-5-Me-isodC
  • dmf-isodG
  • dA+dG (R)
  • dC + dT (Y)
  • dA + dC (M)
  • dG + dT (K)
  • dG + dT (K)
  • dC + dG (S)
  • dA + dT (W)
  • dA + dC + dT (H)
  • dC + dG + dT (B)
  • dA + dC + dG (V)
  • dA +dG + dT (D)
  • dA+dC+dG+dT (N)

◆Chain Terminators

End Blocker Oligo Modification

  • 1,2-Dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate tripeptide
  • 2′, 3′ Dideoxyadenosine (2,3ddA)
  • 2′, 3′ Dideoxycytosine (2,3ddC)
  • 2′, 3′ Dideoxythymidine (2,3ddT)
  • 2′,3′ Dideoxyguanosine (2,3ddG)
  • 3′ Phosphate
  • 3′-Deoxycytidine(3′-dA)
  • 3′-Deoxycytidine(3′-dC)
  • 3′-Deoxycytidine(3′-dG)
  • 3′-Deoxycytidine(3’dT)
  • 3′-Spacer C3

Bases Increasing Duplex Stability

◆2′-5′ Linked Oligonucleotides || ◆2′-O-methyl Modified Oligonucleotides || ◆C-Propyne Analogues || ◆C5-Methyl Analog || ◆Chimeric Oligos || ◆Methylphosphonate || ◆Morpholino Oligonucleotides || ◆Phosphorothioate

Photo Cleavable

アミノ | スペーサー | ビオチン | リンカー

◆PC-Amino

  • 5’PC-Amino

◆PC-Spacer

◆PC-Biotin

  • PC-LC Biotin

◆PC-Linker

Bioconjugations

◆Biomolecule-small molecule labelings || ◆Biomolecule-biomolecule conjugations || ◆Immobilization on solid supports

Antisense Oligonucleotides

◆Phosphorothioate oligos (Sオリゴ) || ◆Constrained ribose (ENA, ZNA) || ◆2′ OMethyl Base || ◆2′ Fluoro RNA || ◆Morpholino || ◆5-Me-dC || ◆PropynedC or dU

Quencher

◆Black Hole QuencherTM || ◆Eclipse® Dark Quencher || ◆DABCYL || ◆TAMRA

Fluorophore Labelings

AlexaFluor® | Epoch | ATTO-TEC | FITC | Bodipy® | Oregon Green | Cyanine | その他分子プローブ | Dyomic | Oyster | Rhodamine

◆Alexa Fluor® Dyes

  • Alexa FluorTM 350
  • Alexa FluorTM 405
  • Alexa FluorTM 430
  • Alexa FluorTM 488
  • Alexa FluorTM 514
  • Alexa FluorTM 532
  • Alexa FluorTM 546
  • Alexa FluorTM 555
  • Alexa FluorTM 555
  • Alexa FluorTM 568
  • Alexa FluorTM 594
  • Alexa FluorTM 610
  • Alexa FluorTM 633
  • Alexa FluorTM 647
  • Alexa FluorTM 660
  • Alexa FluorTM 680
  • Alexa FluorTM 700
  • Alexa FluorTM 750

◆Epoch Dye and Quencher

  • Epoch Redmond Red™
  • Epoch Gig Harbor Green™
  • Yakima Yellow
  • Epoch Eclipse™ Quencher

◆ATTO-TEC Dyes

  • ATTO390
  • ATTO465
  • ATTO465
  • ATTO488
  • ATTO495
  • ATTO520
  • ATTO532
  • ATTO540 Quencher
  • ATTO550
  • ATTO565
  • ATTO580 Quencher
  • ATTO590
  • ATTO594
  • ATTO610
  • ATTO612 Quencher
  • ATTO620
  • ATTO633
  • ATTO637
  • ATTO647N
  • ATTO655
  • ATTO680
  • ATTO700
  • ATTO720
  • ATTO740

◆Fluorescein Dye

  • Fluorescein (6-FAM)
  • Fluorescein
  • 6-Fluorescein
  • Fluorescein dT
  • 3′-(6-FAM) PS
  • JOE
  • Hexachloro-Fluorescein (HEX)
  • Tetrachloro-Fluorescein (TET)

◆Bodipy® Fluorophores

  • BODIPY 493/503™
  • BODIPY 558/568TM
  • BODIPY 564/570TM
  • BODIPY 576/589TM
  • BODIPY 581/591TM
  • BODIPY TMR-X™
  • BODIPY TR-XTM
  • BODIPY 530/550TM
  • BODIPY-FL BR2TM
  • BODIPY-FL-X™

◆Oregon Green

  • Oregon Green® 488, 5- Isomer
  • Oregon Green® 488, 6- Isomer
  • Oregon Green® 514

◆Cyanine Dye

  • Cy3™
  • Cy3.5Tm
  • Cy5Tm
  • Cy5.5Tm

◆Other Molecular Probe Dyes

  • Cascade Blue™
  • 2′-OMeMarina Blue®
  • Pacific Blue®
  • Texas Red® Mix-Isomer
  • Texas Red® Single-Isomer

◆Dyomic Dyes

  • Dy415
  • Dy485XL
  • Dy495
  • Dy480XL
  • Dy505
  • Dy505-X
  • Dy510XL
  • Dy481XL
  • Dy520XL
  • Dy521XL
  • Dy555
  • Dy556
  • Dy554
  • Dy547
  • Dy548
  • Dy560
  • Dy590
  • Dy610
  • Dy615
  • Dy634
  • Dy631
  • Dy632
  • Dy633
  • Dy636
  • Dy635
  • Dy647
  • Dy648
  • Dy650
  • Dy652
  • Dy651
  • Dy660 Quencher
  • Dy661 Quencher
  • Dy677
  • Dy676
  • Dy680
  • Dy682
  • Dy681
  • Dy701
  • Dy700
  • Dy730
  • Dy734
  • Dy731
  • Dy732
  • Dy750
  • Dy752
  • Dy751
  • Dy776
  • Dy780
  • Dy782 (infrared!)
  • Dy781
  • Dy831

◆Oyster Dye

  • High photostability
  • Bright fluorescence
  • Oyster-500 can substitute Cy2, Alexa Fluor® 488, Fluorescein
  • Oyster-556 can substitute Cy3, Alexa Fluor® 555
  • Oyster-645 can substitute Cy5, Alexa Fluor® 647
  • Oyster-656 matches the emission band of a 650 nm laser diode
  • Oyster® 550
  • Oyster® 556
  • Oyster® 645
  • Oyster® 650

◆Rhodamine Dyes

  • Rhodamine GreenTM-X NHS Ester
  • Rhodamine RedTM-X NHS Ester
  • TAMRA™
  • TAMRA™ NHS Ester
  • ROX™ NHS Ester

Redox Labels

◆Dicarboxymethylene Blue || ◆Monocarboxymethylene Blue || ◆Ferrocene, Ferrocene-C6 || ◆Anthraquinone, Anthraquinone-C6

Fluorogenic Probes and Primers for Real-time qPCR

◆Labeled probes || ◆Amplifluor® Direct Primer || ◆Molecular Beacon for Gene Detection and Analysis || ◆Plexor™ Primers || ◆Black Hole Scorpions™ Primers

Probes for Multiplexing qPCR

◆Labeled probes || ◆Amplifluor® Direct Primer || ◆Molecular Beacon || ◆Black Hole Scorpions™ Probe, Uni-molecular



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